Проблема оказалась в том, что я добавил строку в один из моих скриптов профиля bash на сервере, который выводил текст каждый раз, когда я входил в систему, вот так:
export PGVERSION=9.6 echo "PGVERSION=$PGVERSION"
Дополнительный текст вводил в заблуждение плагин JEdit sftp.
Решение состояло в том, чтобы гарантировать, что текст не был отражен, если не говорить с терминалом, поэтому я изменил вторую строку выше:
[ -t 0 ] && echo "PGVERSION=$PGVERSION"