Если я не слишком ошибаюсь, Acrobat масштабирует ограничивающую рамку вокруг содержимого, чтобы оно вписывалось в область печати. Это объясняет различия, которые вы замечаете.
Кроме того, не все принтеры имеют площадь печати в тех же пропорциях, что и бумага. Это также влияет на масштабирование.