Вы можете редактировать сами торрент-файлы, используя Transmission-Edit . Предположительно transmission-edit -a udp://tracker my.torrent
должно работать.
Если вы уже добавили торрент-файл к передаче, вы можете использовать для передачи удаленный доступ, например:transmission-remote -n 'user:pass --torrent 10 --tracker-add 'udp://tracker.url:1337/announce'