Была ли это последняя строка в .bashrc перед установкой anaconda? Если это так, вы можете попробовать добавить новую строку в конце .bashrc перед установкой anaconda.
Часть в Anaconda3-5.3.0-Linux-x86_64.sh, которая добавляет код в .bashrc (строка 719 ... 736)
cat <<EOF >> "$BASH_RC" # added by Anaconda3 5.3.0 installer # >>> conda init >>> # !! Contents within this block are managed by 'conda init' !! __conda_setup="\$(CONDA_REPORT_ERRORS=false '$PREFIX/bin/conda' shell.bash hook 2> /dev/null)" if [ \$? -eq 0 ]; then \\eval "\$__conda_setup" else if [ -f "$PREFIX/etc/profile.d/conda.sh" ]; then . "$PREFIX/etc/profile.d/conda.sh" CONDA_CHANGEPS1=false conda activate base else \\export PATH="$PREFIX/bin:\$PATH" fi fi unset __conda_setup # <<< conda init <<< EOF