Чтобы хранить файлы на загрузочном USB-накопителе с ОС, вам необходимо настроить постоянное хранилище при его первоначальном создании, а затем каждый раз при загрузке на USB-ОС следует сохранять файлы и настройки из предыдущего сеанса. Посмотрите эти инструкции о том, как создать постоянное хранилище на многих различных дистрибутивах Linux.
Вы также можете смонтировать жесткий диск (в большинстве дистрибутивов Linux) с компьютера, на котором вы используете ОС USB, и сохранить их в папке на жестком диске. Поэтому в следующий раз, когда вы загрузитесь в обычную компьютерную операционную систему, файлы должны быть там, где вы их сохранили, и могут захватывать их при каждой загрузке в ОС USB. Однако эта опция не переносима, как опция постоянного хранения.