Установите необходимые пакеты в Debian (Ubuntu):
sudo apt-get install cuetools shntool flac
Разделите файл flac и заполните теги id3:
cuebreakpoints sample.cue | shnsplit -o flac sample.flac cuetag sample.cue split-track*.flac
Некоторые системы имеют cuetag.sh вместо cuetag .