SciTE v2.23 для Windows, кажется, хорошо работает с этими наборами символов для меня. Вы установили кодировку UTF-8?
File -> Encoding -> UTF-8
Дополнительно:
Согласно разделу документации SciTE по кодированию:
SciTE автоматически обнаружит схему кодирования, используемую для файлов Unicode которые начинаются с метки порядка байтов (BOM). Кодировки UTF-8 и UTF-16 распознается как UTF-16 как Little Endian, так и Big Endian. Файлы UTF-8 также будут распознаваться, если они содержат файл cookie кодирования на одном из первых двух строк. Файл cookie для кодирования выглядит примерно так: "coding: utf-8" (за «кодированием» следует «:» или «=», необязательный пробел, необязательная кавычка, "utf-8") и обычно содержится в комментарии.