(простой вопрос, относящийся к конкретному приложению, как этот, принадлежит на форуме поддержки приложения, или, возможно, SuperUser, но не ServerFault, но, как я знаю, и я делаю перерыв в работе, я все равно отвечу)
Вам нужно будет использовать команду «Выбрать файлы» из меню «Метка» (обычно привязанную к клавише numpad: +) и ввести *.php;*.jsв нее свой шаблон соответствия (т.е. ). Затем вы можете работать с выбранными файлами как обычно.