Удаление Windows Update KB2969357
в Панели управления исправило поврежденные файлы.
Однако sfc /scannow
все еще сообщается о невозможности восстановить некоторые безымянные файлы. Восстановление системы не удалось несколько раз и добавил больше ошибок в таблицу.
В конечном итоге я использовал Windows 8.1 RTM DVD и выбрал Upgrade. В Windows сохранены все программы и настройки, а также больше нет нарушений целостности.
И папка Windows сократилась с 24 ГБ до 14 ГБ :)