Отвечая себе, я хотел бы сказать, что нашел хороший способ сделать это. Просто определите файл с именем «.Xkbmap» в домашнем каталоге с таким содержимым, как:
-option compose:ralt,grp:switch,grp:alt_shift_toggle,grp_led:scroll -variant ,lyx us,il
И ваш текущий пользователь должен быть в порядке.
Спасибо всем, кто пытался помочь.