Windows PE (аналогично, например, Windows 7-64) не содержит NTVDM и не может запускать приложения DOS. Поскольку QBasic - чистое приложение для DOS, его вообще нельзя запустить. Попробуйте переписать ваш сценарий на что-то более современное, например, на VBScript (если он должен быть базовым диалектом).
Если это невозможно, вы можете использовать DOSBox (который сам по себе является приложением Windows) для запуска интерпретатора QBasic.