Вы можете использовать стороннее приложение, такое как Duplicate Cleaner или CCleaner, чтобы удалить дубликаты файлов.
Или напишите сценарий PowerShell и вызовите его из командного файла, просмотрите эту ссылку ниже.
найти и удалить дубликаты файлов с помощью только Powershell
https://n3wjack.net/2015/04/06/find-and-delete-duplicate-files-with-just-powershell/