В зависимости от используемой файловой системы вы можете переместить все файлы в другой каталог, удалить исходный каталог, воссоздать его и переместить файлы обратно.
На практике; Вы действительно собираетесь беспокоиться обо всем этом для 20 КБ дискового пространства?