Для меня это звучит так, как будто южный мост / контроллер вызывает проблему.
Поскольку это не повседневная система, и у вас, похоже, есть время и желание, я бы предложил чистую установку:
- Сбросить BIOS к заводским настройкам / очистить BIOS
- Внесите изменения в BIOS, чтобы удовлетворить.
- Запишите все свои диски в нули. (Лично я бы вообще выбрал макстора)
- Определитесь с окончательной установкой (Dual, treble, more boot)
- С помощью компетентного установщика (Linux) вырежьте таблицу разделов. Форматирование каждого файла к его конечной файловой системе может помочь, и перестанет быть глупым.
- Установите любые необходимые вам версии Windows (помните, что они должны быть в основном разделе)
- Установите любой * nix flavour (s) и загрузчик.
То, где вы потерпите неудачу в этом, сузит причину.