Проблема сохраняется, если вы пытаетесь скопировать с помощью CTRL-Insert и вставить с помощью Shift-Insert? Я думаю, что это проблема GTK +. Этот билет поддержки (хотя он старый) предполагает, что могут быть проблемы с более поздними версиями GTK +, работающими на определенных версиях Windows.
Я предлагаю вам попробовать установить несколько разных версий GTK + и посмотреть, не исчезнет ли проблема. Если я правильно помню, вы можете сделать это, сохранив ту же версию Pidgin.