Возможность аннотации, встроенная в Adobe Acrobat (включая бесплатный продукт Reader), может иметь необходимую возможность, которую ищет OP.
Одна заметка по умолчанию не является приложением с поддержкой страниц, и я не знаю, как заставить ее разбивать на страницы определенным образом. Одно из примечаний касается хранения и поиска информации, а не размещения этой информации на бумажном носителе осмысленным или упорядоченным способом.
Еще один вариант, начиная с Office 2016, - открывать PDF-файлы в Microsoft Word, который поддерживает разбиение на страницы и некоторые ограниченные возможности рисования от руки.