Да, вы можете легко и безопасно скопировать раздел, если он не смонтирован - это никак не связано с наличием Live CD или нет. Это очень просто. Многие дистрибутивы Linux (например, Ubuntu) будут искать на ваших жестких дисках любые другие загрузочные системы и автоматически включать их в меню Grub при каждом обновлении ядра.
Подойдет любая загрузочная система Linux. Думаю, было бы так же просто установить базовую копию обычного дистрибутива. Вы также можете клонировать разделы в файлы в существующей файловой системе - это не обязательно разделение на разделы. Существуют различные инструменты для помощи - например, пристрастие.