Да, это возможно. Например, Debian включает yumи rpmв свои стандартные репозитории. Кроме того, многие языки программирования имеют свои собственные инструменты управления пакетами, используемые только для установки модулей для этого конкретного языка - например, у меня есть Perl cpanm, Ruby gem, Haskell cabalи Python pipв дополнение к общесистемному менеджеру пакетов.
Однако использование двух системных менеджеров в масштабе всей системы - например, dpkgи rpm- очень быстро вызовет проблемы ; в основном из-за конфликтов файлов, когда менеджер A пытается установить программу, которая уже была установлена менеджером B.
Кроме того, разные дистрибутивы имеют разные политики упаковки. debпакеты, как правило, создаются для Debian, в то время rpmкак в основном они используются Red Hat / Fedora / CentOS, и они используют разные initscripts, файлы конфигурации и расположения данных программы. Использование пакетов /etc/sysconfigбудет разбито в основном на debсистемы.