Возможно монтировать / proc в среде chroot - подробнее об этом смотрите в этом ответе .
У меня были бы опасения, что программа не сможет получить доступ к другим процессам, так как большая часть (если не вся) этой информации может быть доступна через / proc (/ proc / [pid number] даст вам доступ к этому).
Непонятно, что вы подразумеваете под «изменениями в файловой системе», но если эти изменения относятся к файловой системе, исключая специальные биты, такие как / proc, / dev / etc, они останутся в chroot.