Оказывается, это было вызвано установкой SAGE_PATH для пакетов сайта python.
Оглядываясь назад, я понимаю, что это, вероятно, перезаписало встроенные графические библиотеки Sage и привело к тому, что графики были построены с компьютера, на котором был запущен sage.