Почему вы используете губернатор пространства пользователя? Согласно документации ядра Linux ( Documentation/cpu-freq/governors.txt
в исходном коде ядра):
Регулятор CPUfreq «userspace» позволяет пользователю или любой программе userpace, работающей с UID «root», устанавливать CPU на определенную частоту [...]
ИМХО, это также означает, что частота процессора не будет адаптироваться к нагрузке при выборе этого регулятора. Я бы посоветовал вам переключиться на «ondemand» или «консервативный» регулятор и посмотреть, что происходит, когда процессор загружен. Я надеюсь, что это решит вашу проблему.