FLV был покалечен. [flv @ 0x7fe8a8fffdc0] header damaged
Нет необходимости перекодировать его в другой кодек / формат, просто перестройте его.
Я перестроил видео ffmpeg
, скопировав аудио и видео кодеки:
$ ffmpeg -i video.flv -c:v copy -c:a copy fixed.flv ... [flv @ 0x63ff80] Found invalid index entries, clearing the index.
Отнимает часть времени по сравнению с перекодировкой, например, в x264.