Во-первых, это не работает так, как вы думаете.
Команды в скрипте выполняются последовательно. su(Было это удалось) будет выполнять интерактивный сеанс работы с оболочкой и ждать ввода пользователя (команды). Только после того, как suсуществует, второй whoamiработает (показ username).
Во всяком случае, ваш suне работает на самом деле.
Во-первых, suточно выводит какое-то сообщение об ошибке. Что это такое? Вы фиксируете только стандартный вывод в ваших командах. Захватить вывод ошибки тоже ( 2>&1). Скорее всего, происходит сбой, поскольку suможет потребоваться интерактивный терминал, в то время как Plink с -mкоммутатором по умолчанию использует неинтерактивный терминал. Добавление -tпереключателя помогает в этом случае.
Обратите внимание, что автоматизация suвообще плохая идея. Если вам нужно выполнить некоторые команды, требующие прав суперпользователя, лучшим решением будет связать выделенный закрытый ключ с командами в sudoersфайле. А потом используйте sudoи закрытый ключ в Plink.