Tor направляет весь сетевой трафик через нечто похожее на VPN (путем создания сетевого маршрута).
При использовании других решений, таких как встроенный клиент Windows VPN, либо служба, работающая в качестве SYSTEM, либо сама операционная система будут вносить изменения в маршрутизацию от вашего имени, не делая вас аутентифицированными как администратор.
Поскольку Tor не использует такой сервис, а операционная система не делает специальных допусков для программы Tor, Tor должен сам внести эти изменения и, следовательно, нуждается в административных правах.
Я упоминаю Windows, потому что это то, с чем я больше всего знаком, но, похоже, аналогичный аргумент применим к Linux.