Репозиторий был создан / клонирован пользователем, отличным от того, который выполнял компиляцию. Таким образом, пользователь, выполняющий компиляцию, не имеет разрешения на запись в папки, в которые компиляция хочет записатьautom4te.cache
sudo chown -R pi:pi /home/pi/download/usb-miner/software/cgminer
Устранит проблему - пользователь pi
станет владельцем каталога репозитория, что позволит пользователю компилировать pi
записи в эти папки.