Эти разрешения не совпадают. RX сильнее, но разница не может быть значимой для вас.
GR и GE являются общими разрешениями, которые включают чтение, запись и обход. RX также включает разрешение на «чтение расширенных атрибутов», которое не требуется для IIS. Расширенные атрибуты определяются программами, поэтому могут различаться, и, скорее всего, у вас их нет.
В вашем случае оба будут работать, хотя они не идентичны. Однако всегда желательно ограничить разрешения для папок IIS до самого предела, поскольку некоторые разрешения могут использоваться хакерами непредвиденным образом.
Смотрите эту статью, которая рассекает все разрешения NTFS.