Mount --bind должно быть быстрее, чем символическая ссылка.
Если вы mount -B /mnt/portage /usr/portageчитаете /usr/portage, вы получите i-узел /mnt/portageи он должен работать так же быстро, как обычный каталог.
Разрешение символьной скорости соединения будет зависеть от количества компонентов в связанном пути, поэтому для /usr/portageсвязанного с /mnt/portageним будет три дополнительных чтения i-узла и два поиска в каталоге.
Я сомневаюсь, что вы заметите какую-либо разницу между этими методами, если вы действительно не используете эти файловые системы.