Вам просто нужно две вложенные for
циклы: -
for /d %d in ("\Full\Path\To\Folder 1"\*) do ( cd "%d" & for /d %s in (*) do xcopy /s "%s"\* "\Full\Path\To\New folder\%s"\ )
Если вы поместите его в пакетный файл, вам нужно удвоить %
знаки.
Использование cd
- это один из вариантов, но вы также можете использовать полные пути к каталогам, хотя для определения целевого пути потребуется разбор переменных.