Современные SoC, которые можно найти в дешевых ультрабуках, используют eMMC со спецификацией 5.x. Интерфейс 5. + может обрабатывать данные со скоростью до 400 МБ / с. В большинстве случаев SoC будет иметь выделенный контроллер eMMC, имеющий 8-полосный параллельный интерфейс.
На практике флешки USB 3.0 используют те же eMMC, но с мостом USB-MMC.
Кажется очевидным, что прямое соединение с IC eMMC лучше, чем соединение через любой мост.
Конечно, производительность будет отличаться в зависимости от внутренней архитектуры чипа eMMC, которая используется в конкретном устройстве. Но вам будет трудно найти флэш-память USB 3.0, работающую быстрее, чем 100 МБ / с при записи и чтении. Все ставки на то, что внутренняя флэш-память будет лучше работать под управлением ОС.