И да и нет!
Это действительно зависит от используемой вами программы.
Обычно Save to PDF поддерживается в очень немногих приложениях (либо Adobe, либо разработчиком программы). Он создает расширенный файл PDF, который обычно имеет дополнительные функции - например, если у вас есть гиперссылки в документе, они будут сохранены.
Печать в PDF отличается, как и для любой программы, которая может печатать. Он в основном перенаправляет то, что выйдет из вашего принтера, в файл PDF. В приведенном выше примере с гиперссылкой - В Microsoft Word он обычно будет отображаться синим текстом (как на обычной бумаге), если вы не отформатируете его вручную!
При этом я считаю, что некоторые принтеры PDF пытаются сохранить некоторые расширенные функции, однако вышеизложенное должно быть справедливо для большинства.