Caliber утверждает, что это универсальное решение для всех ваших потребностей электронных книг.
Форматы ввода: CBZ, CBR, CBC, EPUB, FB2, HTML, LIT, LRF, MOBI, ODT, PDF, PRC **, PDB, PML, RB, RTF, TXT
Выходные форматы: EPUB, FB2, OEB, LIT, LRF, MOBI, PDB, PML, RB, PDF, TXT
Calibre является бесплатной (и может использоваться портативно, проверьте их форум)