Можно сначала уменьшить объем, а затем выполнить pvmove, а затем удалить физический диск.
Допустим, используется 5 ГБ пространства.
Сначала проверьте файловую систему.
e2fsck /dev/vg/lv
Измените размер файловой системы, чтобы она занимала немного больше места (например, 6 ГБ).
resize2fs -p /dev/vg/lv 6G
уменьшите lv до меньшего размера> или = размера файловой системы.
lvreduce -L 6G /dev/vg/lv
выровняйте конец файловой системы с концом тома.
resize2fs -p /dev/vg/lv
затем pvmove из исходного раздела в целевой раздел.
pvmove /dev/sda5 /dev/sda6
затем проверьте, выделены ли PhysicalExtents.
pvdisplay
Если PE не выделены, можно безопасно удалить раздел из lvm.
pvremove /part/to/be/removed