Чтобы иметь возможность рисовать окна (за кадром), чтобы создавать миниатюры, KWin просто показывает их как свернутые, хотя на самом деле это не так.
Таким образом, окна могут быть сведены к минимуму, насколько может судить пользователь, но на самом деле это не так.
Это может привести к проблемам с приложениями, которые хотят знать, минимизированы ли они или нет, но в действительности у вас не должно возникнуть никаких проблем при выборе этой опции.