По таким вопросам, касающимся совместимости программ с вином, вы всегда можете обратиться к официальной БД приложения по адресу https://appdb.winehq.org.
Специально для Adobe After Effects направьте свой браузер по адресу https://appdb.winehq.org/objectManager.php?sClass=application&iId=648, чтобы узнать, что все версии начиная с CS4 и выше оцениваются как мусор, то есть нельзя использовать с wine:
