Firefox хранит такую информацию в отдельной папке профиля, которая отслеживает все ваши личные настройки, закладки и историю. Это также означает, что он хранится отдельно от установки, поэтому установка новой версии не должна влиять на него.
Чтобы быть абсолютно уверенным, вы можете сначала сделать резервную копию вашего файла hosts.sqlite в папке вашего профиля, а затем восстановить его, если обновление не сохранило его.
Более старые версии Firefox использовали два отдельных файла для закладок и истории: bookmarks.html и history.dat. Однако, начиная с Firefox 3, они переключились на использование одного файла place.sqlite. Если вы пришли из старой версии Firefox. Было бы трудно сохранить его, но, поскольку ваш Firefox новее, чем Firefox 3, у вас не должно возникнуть проблем с обновлением.