NTLM / v2 имеет отношение к аутентификации пользователя по сети. Решение о LMCompatibilityLevel должно учитывать типы систем, используемых в среде, и насколько высока угроза атаки. Если ваш O / S достаточно свежий, я бы об этом не беспокоился.
Смотрите NTLMv2 на wikipedia.org.
Но еще лучше эта статья: Наиболее неправильно понятая настройка безопасности Windows за все время .