Посмотрите этот вопрос, который непреднамеренно отвечает на ваш вопрос.
Okular не сохраняет аннотации в самом документе, а сохраняет их в XML-файле в месте, указанном ниже. Если формат в XML не распознается другим читателем - Evince - тогда вам не повезло.
В вашем случае, если Okular не может найти аннотации, убедитесь, что у вас есть каталог (~ / .kde / share / apps / okular / docdata).
Обратите внимание, что Okular сам по себе не предназначен для чтения PDF, а использует «бэкэнды» - см. Эту ссылку