Для ссылки на таблицу в формуле условного форматирования вам нужно будет использовать INDIRECT("<Table_Name>")
.
Таким образом, ваша формула будет: =VLOOKUP($A2,INDIRECT("Table3"),2,FALSE)>=B$1
Я не знаю почему, но это просто работает.
Справка: Как использовать имя таблицы в списках проверки данных и формулах условного форматирования
(Кстати: почему бы вам просто не использовать условное форматирование «Панель данных» в вашей таблице? Это было бы намного проще.)