ffmpeg
может декодировать только AIC, но последняя версия iMovie будет принимать ProRes *:
ffmpeg -i input -c:v prores -c:a pcm_s16le output.mov
Вы также можете попробовать повторно преобразовать исходные данные в контейнер MOV:
ffmpeg -i input -c copy output.mov
Это будет быстрее, чем перекодирование в ProRes, но оно не будет работать в iMovie для всех входных данных (сомнительно, mpeg1video будет), и iMovie может перекодировать его в любом случае.
* Я не уверен, что iMovie автоматически перекодирует его в другой формат.