Да, это именно то, что вы можете сделать с помощью сценария оболочки. Вы уже выполнили 90% работы по точному определению того, что должен делать ваш алгоритм. Позвольте мне заполнить некоторые пробелы.
Cygwin предоставит вам среду сценариев bash. Этот ответ подсказывает, как перебирать список вещей в bash. grep проверит структуру имени папки и извлечет интересующие ее части (например, имя исполнителя). mkdir создаст каталоги (вы можете захотеть изучить эту -p
опцию), а rmdir удалит их. mv фактически переместит файлы из одного каталога в другой.