Если ваш код связан с моделью, вы можете использовать «Проект» -> «Разработка исходного кода» -> «Синхронизировать содержимое пакета» (Ctrl + Alt + M), а затем «Обратный инжиниринг (источник -> модель)».
Enterprise Architect использует имена каталогов, указанные при первоначальном импорте / создании источника проекта, и обновляет либо модель, либо исходный код в зависимости от выбранной опции.