Чтобы избежать слишком большой ошибки файла, вы можете использовать --max-size=SIZEопцию, найденную на странице man, которая скажет rsync игнорировать файлы выше определенного размера.
Так что в вашем случае команда будет похожа на:rsync --max-size=3999m /source/files /dest/files