Я не использовал его лично, но мне порекомендовали BlueHarvest для этого ...
http://www.zeroonetwenty.com/blueharvest4/
С сайта:
Самый простой способ сохранить ваши диски и файловые серверы в чистоте от «пыли» Mac. BlueHarvest автоматически удаляет файлы DS_Store и ._ AppleDouble (вилки ресурсов) с ваших USB-ключей, SD-карт, файловых серверов и т. Д. BlueHarvest удаляет эти элементы по мере их создания, поэтому вы всегда будете свободны от пыли.