Позволяет зашифровать хранит информацию о том, какие домены он должен проверить для обновления в реестре Windows. Он расположен в HKEY_CURRENT_USER\Software\letsencrypt-win-simple\https://acme-v01.api.letsencrypt.org/Renewals.
Откройте настройки реестра и добавьте отсутствующий домен в список. Каждый домен находится в новой строке, и, надеюсь, у вас есть еще один домен в списке, использующий почти те же настройки, чтобы вы могли легко копировать и редактировать его.
Не забудьте установить дату обновления записи на дату, которая прошла!
Я сделал это успешно, и при следующей проверке обновления сертификат был обновлен.