Ну, как говорится в комментарии @aviv (и это должен был быть ответ), безопасно удалить эти файлы.
Я бы добавил, что, в общем, неплохо использовать рабочий каталог для таких вещей. Похоже, что это был скрипт, который загружал и извлекал исходный код, компилировал и связывал вещи (что объясняет файлы lo - которые являются объектами libtool) и нигде не был достаточно хорошо подготовлен, чтобы убирать за собой.
Кажется, что инструкции указывают на то, что предполагается создать папку для себя, извлечь исходный код и, в основном, сделать то же самое, что и build-dep, захватить файлы deps, создать и выполнить установку. За исключением того, что файлы разбираются повсюду, кажется, что он сделал то, что мог бы сделать любой опытный пользователь.
Предполагая, что это просто стандартная сборка, запуск make clean в папке, возможно, привел в порядок вещи, поскольку он удаляет все связанные файлы, предполагая, что все было просто оставлено там. Сделал бы жизнь несколько проще.