Если другие люди окажутся здесь, попробуйте:
1. Что сказал @xenoid
1) Убедитесь, что вы можете запускать эти программы из терминала и чтобы они все еще работали (у них могут быть зависимости, не разрешенные в новой системе).
2) Создайте
.desktop
файл для каждого из них (где-то в вашей системе должен быть редактор меню приложения).
2. Если это не удается
Затем попробуйте переустановить ваши программы, установка может / не может быть быстрее, поскольку у вас есть файлы в вашем /home
разделе.
Не стесняйтесь добавлять свой собственный ответ.