Просто для уточнения терминологии.
Правильная команда вызывается chkdskи обычно называется таковой.
Ваши диски называются drivesдля краткости.
Теперь, что касается работы chkdskна ваших дисках, не имеет значения, является ли он первичным или вторичным. Chkdsk не будет работать в режиме «исправить» на подключенном диске. Вместо этого вам будет предложено отключить диск или, в случае основного диска, запланировать chkdsk во время следующей перезагрузки.
Это исключает возможность использования накопителя во время сканирования.