Да, веб-сайт может обнаружить, что Adblock Plus установлен, ссылаясь на файл Javascript, который, как известно, заблокирован Adblock Plus (поскольку он соответствует правилу по умолчанию), и проверить, был ли выполнен этот код Javascript, проверив, например, переменную.
Смотрите объяснение здесь: Как обнаружить Adblock Plus
И более подробная информация в Википедии: Adblock - Обнаружение .