О, сервер действительно запустился, независимо от сообщения об ошибке. Смотрите также https://dba.stackexchange.com/questions/189341/can-an-encrypted-mysql-restart-without-the-keyring-file-on-the-box :
Да, mysql запустится, но вы получите сообщение об ошибке, если попытаетесь получить доступ к зашифрованной таблице.