Zypper автоматически обновляет репозитории при запуске. Отключи это.
Перейдите в YaST, нажмите «Программное обеспечение», а затем «Хранилища программного обеспечения».
Далее выберите репозиторий и убедитесь, что автоматическое обновление отключено.